サーバ全体の文字コードがEUCでそれをhtaccessにて強引に文字コードを代えている。

その設定をしていた初期にWPをいれてたディレクトリは日本語URLが認識され表示されていたが
トップディレクトリには文字コードを変更する設定をいれていないために日本語URLなどが認識されないために通常とはことなる挙動を行った。

私が手動でカスタム投稿を設定した際は投稿タイトルを半角英数で入力したためにちゃんと表示された。
なんという落とし穴。

サーバの文字コードは大事ね。