HTML5のソースをドリーのテンプレートにするとそのままだと文字コードの認識がなくなり強制的にshift-jisになります。
それの回避方法
文字コードの指定を

<!--TemplateBeginIf cond="0" -->
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />
<!--TemplateEndIf -->
<meta charset="utf-8" />

とします。

Template Ifを使い

をテンプレート時のみ表示させます、
テンプレートから発生したHTMLには表示されません。

また、順番は上記の順番でないと発生したページに反映されないことがあるそうです。